O guia de apoio à utilização do "Magalhães" é destinado aos pais e educadores e foi criado pelo Centro de Competência da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa a pedido do Ministério da Educação. O documento apresenta sugestões e conselhos sobre como devem acompanhar-se de perto as actividades realizadas pelas crianças no computador, para que possam tirar o melhor partido do "Magalhães", mas também para desenvolver hábitos de uso seguro das novas tecnologias. Assim, os pais devem conversar frequentemente com os filhos sobre o computador e a Internet, pedindo-lhes que partilhem aquilo que sabem fazer.
Este guia está disponível através da Internet e dá ainda "dicas" acerca das melhores formas de proteger as crianças dos eventuais riscos associados à Internet e de como prepará-las para a utilização segura desta ferramenta.